علم الطفيليات الطبية‏ هو العلم الذي يُعنى بدراسة الطفيليات التي قد تصيب الانسان ، والأمراض التي تسببها، والصور السريرية والاستجابة التي يولدها البشر ضدهم، كما أنه يهتم بالطرق المختلفة لتشخيص، وعلاج، والوقاية من، ومكافحة هذه الامراض.

فالطفيل هو كائن حي يعيش على أو داخل كائن حي آخر يدعى المضيف مكونا علاقة معقدة تتطلب دراستها توليفة من التخصصات الأخرى، وتعتمد على تقنيات من مجالات مثل بيولوجيا الخلية، والمعلوماتية الحيوية، والكيمياء الحيوية، وعلم الأحياء الجزيئي، وعلم المناعة، وعلم الوراثة، والتطور، وعلم البيئة. كما يختص ايضا بعلم استحداث وتطوير الادوية وعلم الدراسات الوبائية وعلم الامراض المشتركة حيوانية المنشأ.

علم الطفيليات الطبية هو واحد من أكبر المجالات في علم الطفيليات، حيث أشار عالم الطفيليات كوكس إلى أن "البشر يستضيفون ما يقرب من 300 نوع من الديدان الطفيلية، وأكثر من 70 نوعًا من الطفيليات، بعضها مشتق من أسلافنا الرئيسيين وبعضها تم الحصول عليه من الحيوانات التي قمنا بتربيتها أو تم الاتصال بها خلال تاريخنا القصير نسبيًا على الأرض.

يختص قسم الطفيليات بتدريس مادة الطفيليات الطبية بفروعها المتعددة والتى تشمل الديدان و الاوليات و الحشرات الطبية. ويتم تدريس مادة الطفيليات لطلاب مرحلة البكالوريوس فى النظامين القديم والحديث كما يختص قسم الطفيليات أيضا بتدريس العديد من مقررات الماجستير – الدكتوراه لطلاب الدراسات العليا.