علم الباثولوجيا الاكلينيكيه والكيميائيه يعتبر جزءا من علم الباطنه العامه وهو علم متخصص فى تشخيص جميع الامراض الباطنيه وامراض الاطفال وهذا يسمى علم باطنه خاصه ويدرس لطلبه البكالوريوس فى علم الباطنه ويشمل هذا القسم على تدريس هذا العلم للطلبه فى مرحله البكالوريوس وممارسه هذا التخصص من خلال معمل المستشفى الذى يخدم مرضى المستشفى للمرضى المحجوزين بالمستشفى والمرضى المترددين على العيادات الخارجيه ويقدم القسم الخدمات للمرضى فى النخصصات الدقيقه الاتيه :

- تخصص امراض الدم والتحاليل الخاصه بتشخيص امراض الدم المختلفه من صور كامله للدم وتشخيص امراض السيوله والتجلط وتحاليل القص و الطحال – تحاليل خاصه بتشخيص امراض الدم الخبيثه ( سرطان الدم المختلفه ) ويتم هذا التشخيص باستخدام اجهزه متخصصه وحديثه تعمل بتكنولوجيا متخصصه فى تشخيص امراض الدم المختلفه وايضا اجهزه التدفق الخلوى لخدمات الدم المختلفه .

- تخصص التشخيص لكيمياء الدم ويشمل قياس دقيق لهرمونات الدم وكيمياء الدم والسموم المختلفه .

- تخصص المناعه الاكلينيكيه ويشمل تشخيص امراض المناعه المختلفه من نقص المناعه والامراض المناعيه المختلفه التى تصيب الانسان .

- تخصص الامراض الميكروبيولوجيا والفيروسات والبكتيريا والامراض المعديه بوسائل متقدمه من اجهزه متخصصه فى عمل المزارع المختلفه للامراض المعديه وعلى رأسها مرض الدرن ووسائل متقدمه فى تشخيص هذا المرض .

- تخصص نقل الدم ويشمل بنك دم الدم الامن لمرضى المستشفى ومرضى الجراحات المختلفه وايضا توفير مستشفيات الدم المختلفه الامنه بعد عمل التحاليل الدقيقه للتاكد من سلامه الدم

- تخصص البيولوجيا الجزيئيه وهذا التخصص خاص بالتشخيص الجينى للامراض الوراثيه ويشمل هذا التخصص التشخيص بواسطه اجهزه الهندسه الوراثيه واجهزه تتبع الحمض النووى للخليه .