وافق المجلس الأعلي للجامعات بقراره رقم 188 بتاريخ 26/11/2006م علي إنشاء مركز حضارة وتراث الفيوم كوحدة ذات طابع خاص تتبع جامعة الفيوم بحيث يكون له الأستقلال في ﺇدارة شئونه المالية واﻹدارية والفنية طبقاً لأحكام البند 14 من المادة 193 من قانون تنظيم الجامعات رقم 49 لسنة 1972 ولائحته التنفذية.