تأسست كلية العلوم جامعة الفيوم بقرار جمهوري رقم 23 لسنة 1995 كاحدى الكليات التابعة لجامعة القاهرة (فرع الفيوم). وبعد ذلك صدر القرار الجمهوري رقم 84 لسنة 2005 بإنشاء جامعة الفيوم وأصبحت كلية العلوم تابعة لجامعة الفيوم. شهدت الكلية منذ إنشائها حتى الآن تطورات هامة فى أقسامها العلمية وبرامجها الأكاديمية وتوجهاتها العامة، فقد بدأت الكلية فى السنه الأولى 1995/1996 بعدد قليل من أعضاء هيئة التدريس بالإضافة إلي عدد من أعضاء هيئة التدريس ينتدبون للعمل بالكلية من جامعات أخرى لسد العجز فى أعضاء هيئة التدريس بالكلية. في عام 2016 وصل عدد أعضاء هيئة التدريس بالكلية إلى 160 عضو هيئة تدريس بينما وصل عدد الهيئة المعاونة من المدرسين المساعدين والمعيدين إلى 65